如果两笔长期借款记账在一起，需要将其分离以便更好地记录和管理。首先要确定每笔借款的具体数额和对应的利率。然后可以将其分别记入两个不同的账户或者将其拆分成多个小笔借款，以便更好地跟踪偿还和利息支出情况。

对于已有的记账记录，可以通过编辑或重新记账的方式进行修改，以确保准确性和一致性。在分离长期借款记账时，需要保证记账信息的清晰明确和准确无误，以便有效地管理资金和进行财务决策。

两笔长期借款记帐在一起就要在长期借款下面设立二级科目，就能区别二笔借款。