医保中心应付总额是由以下几方面来计算的：

首先，医保中心需要根据患者所报销的医疗费用总额来计算出其个人账户累计支付和基本医保给予的医保待遇金额。

其次，医保中心还需要考虑医疗机构所提供的医疗服务种类和等级等因素，来确定详细的费用报销标准。

最后，医保中心还需要核算医保基金不同来源的收入和用于报销的支出，以确保整体经费使用的平衡性和公平性。总体而言，医保中心应付总额的计算需要综合考虑多种因素，以确保基本医疗保险制度的运行效率和患者的医疗消费期望都能够得到满足。