印尼的高铁采用有砟轨道是因为砟石铺设的轨道可以提供更稳定的铺设基础，以及更好的承重能力。有砟轨道可以通过砟石的填充和紧实，减少地震和其他自然灾害对轨道的影响。此外，有砟轨道还可以更好地排水，减少雨水对轨道的侵蚀和损坏。因此，选择有砟轨道可以提供更高的轨道稳定性和安全性，适应印尼的地理和气候条件。

原因是:

因为印尼高铁出站后的非高架区段等低速、地面区段，因为温度变化造成铁轨的伸缩、地质问题，为了防止地基沉降，所以用了有砟轨道。

对于人口稀疏、客流量少的线路为了节约成本，一般会选择有砟，但是对于桥梁、隧道、涵洞等维护成本高的路段，一般会采用无砟。