2023年云南中医药大学全国最新排名第682位，位列云南省内排名第5名。

国内排在云南中医药大学之前的高校是：邵阳学院（全国第681名），排在之后的是：重庆警察学院（全国第683名）；在云南省内位居云南中医药大学之前的是：云南师范大学（省内第4名），排在之后的是：云南财经大学（省内第6名）。

2022年,云南中医药大学最新排名全国第332名(参考的是2021年的综合排名数据)。 排在云南中医药大学前3位的分别是:江汉大学(综合排名:321)不同年排名会有所不同。