在小区顶楼进行违建的话，所建造出来的建筑属于违章建筑，违章建筑都是没有经过相关部门的审批的，而且还存在着安全隐患，一般情况下，相关部门都会给予业主自行拆除的处罚。

假如业主拒不拆除的话，那么相关部门就会安排人员强制帮忙拆除，若业主阻碍工作人员执行公务的话，根据情节的轻重给予业主行政处罚或者是刑事处罚。