重庆交通大学是一所以桥梁，遂道，道路建设为主的一所双非大学，属重庆市教育局直管的二本本科院校。四川农业大学是以农业科学为主的211工程大学，属四川省教育厅管辖。两个学校各有不同的专长，不过从学校层次上四川农业大学属211大学，应与重庆交通大学好。

四川农业大学是211，主要适合于农学专业，重庆交通大学是普通一本，主要适合于理工科专业。