南京大学的王牌专业主要有哲学、中国语言文学、外国语言文学、物理学、化学、天文学、大气科学、地质学、生物学、材料科学与工程、计算机科学与技术、化学工程与技术、矿业工程、环境科学与工程、图书情报与档案管理，一共有15个专业，这也是南大的国家重点学科。

电子信息科学与技术、软件工程、建筑学、地质工程等专业。