江西医学高等专科学校是专科学校，不是本科学校，当然毕业证也只有本科和专科之分，没有一本二本之分。

学校前身是创办于1951年的江西省第五医士学校，1953年改名为上饶卫生学校，1958年在卫校的基础上创办上饶医学高等专科学校，1959年更名为赣东北医学院，1978年经江西省人民政府批准成立江西医学院上饶分院。

2013年3月经江西省人民政府批准设立江西医学高等专科学校。