有。

1972年，原南京方家营中学改名为南京市第三十九中学，同时设立了高中部。

近年来，该校不断加强与国外中学的教育教学研究与交流，先后与美国、澳大利亚、新西兰等国家的中学建立了友好关系，并经常开展双边交流活动。 学校决心再用2-3年时间，创建成高质量、有特色、规范化、现代化的省级重点高中。

根据该题所问问题，南京39中学有高中部 1972年方家营中学正式更名为南京市第三十九中学，同年该校就开设了高中部。三十九中建校至今已有60周年的悠久历史。