企业年金是有保管费的。企业年金一般是由个人缴费部分和企业缴费部分组成。两部分资金一般会委托给银行进行监管，然后交由第三方基金公司进行运作。通过第三方基金公司运作，产生收益，使得你和企业缴纳的资金不断增值。而第三方基金公司运作资金，是要收取一定的费用的。