合作医疗二次报销的标准是 ，凡遇到大病住院，医药费过大，造成家庭生活极端贫困的农民，随着人们的收入提高 ，新农合的报销比例也增高，但实话实说，还是有一部分农民在得了重大疾病，陷入因病致贫和因病返贫的困境， 因此，凡遇到大病，住院，医药费过大，造成家庭生活极端贫困的就能申请大病救助，也就是二次报销 。

另外下面15种疾病，如唇恶劣，乳腺癌，宫颈癌 重性精神疾病，耐药肺结核 儿童白血病先天性心脏病，终末期肾病，艾滋病机会性感染，肺癌，食道癌，胃癌，结肠癌，血友病，慢性粒细胞白血病 当都可以享受新农合大病二次报销