医保卡在药店购买药品的额度限制主要取决于你卡中的余额有多少，医保卡购买药品是有相关规定限制的。并不是所有的药品都是可以用医保卡支付。

药品是有分甲类、乙类药品的（具体怎么划分不是很清楚），一般甲类就是可以用医保卡全额扣掉，但是乙类就是医保卡报销一定比例，自付一定比例（一般是10%），另外就是不能用医保卡余额抵扣的药品了。