南京农业大学2023年各专业平均保研率19%，在211高校中属于中等偏上水平。其中，动物科学专业保研率达72.73%，另有4个专业超过60%、2个专业超过50%；目前计算机专业保研率仅有7%。

该校2023届本科毕业生4375人，共有834名获得保研资格，总体保研率19.06%。其中，农林类专业保研率最高，信息等工科类专业保研率较低。