合肥学院原名是合肥联合大学，由时任合肥市委书记郑锐和中国科大副院长、居里夫人中国籍徒弟、新中国放射化学奠基人杨承宗先生创办。

2002年3月，经教育部批准，原合肥联合大学和合肥教育学院、合肥师范学校合并组建合肥学院。

2017年2月，合肥大学正式启动筹建。