没有本质上的区别。

卫生院是设在基层的医疗卫生机构，属于基层的事业单位，合同工和正式工没有本质上的区别，事业单位都要签订正式的劳动合同关系的，只要你表现好，有一定的能力，就会一直在卫生院工作下去。