深圳宝安区的工厂最多。宝安区是深圳市的重要工业基地，有着丰富的工业资源和优越的地理位置，吸引了大量的企业和工厂进驻，形成了庞大的工业园区和产业链，因此工厂数量最多。此外，龙岗区、福田区等地也有不少工厂，但相对于宝安区而言数量较少。