因为普陀山是个岛，所以南京到普陀山是没有办法高铁直达的。

综合考虑，上海方向是最佳方案，规划如下：

1、南京-上海（三个班次7点-8点，历时100分钟左右，票价140元）2、上海汽车南站-舟山普陀（六个班次9点-12点，历时4小时左右，票价130元）