医学信息工程主要研究医学信息、信息管理、医院信息系统等相关的知识和技能，于医疗单位进行医药信息系统的开发建设、医院信息的管理、医疗设备的操作等。例如：医院病人信息系统的设计开发、病人病历档案的管理、药品库存数量的管理、B超等设备的操作等。