南方航空明珠经济舱类似于某些航空公司的超值经济舱或者高级经济舱，相较于南方航空经济舱，一般情况下，座位间距更大，多一瓶饮用水，一条毛毯，一份报纸。

在部分机场，会有专门的值机柜台和优先于经济舱的登机顺序。在机上，座位区域位于公务舱和普通经济舱之间。南航明珠会员乘机后会获得更高的里程累积。