铁路退票需要扣除手续费是因为火车票的销售和退票都需要一定的成本，包括票务系统、售票员工资、设备维护等费用。此外，退票也会对其他旅客购票造成一定的影响，可能导致余票减少或者需要更多时间和人力进行处理。因此，为了平衡成本和服务，铁路公司需要收取一定的退票手续费。