年末全县总人口169232人，其中少数民族156641人，农村人口131003人。

2000年，麦盖提县辖1个镇、9个乡。根据第五次人口普查数据：全县总人口201810人，其中：麦盖提镇26640人、巴扎结米乡20108人、希依提敦乡12108人、央塔克乡25256人、吐曼塔勒乡20164人、尕孜库勒乡20581人、克孜勒阿瓦提乡21202人、库木库萨尔乡9608人、昂格特勒克乡4416人、库尔玛乡11902人、兵团43团虚拟多12275人、兵团45团虚拟乡12561人、兵团46团虚拟乡2888人、兵团前进水库虚拟乡788人、军区麦盖提农场虚拟乡1313人。