用人单位扣留劳动者的工资是不合法的。

用人单位未及时足额支付劳动报酬的，劳动者可以解除劳动合同，用人单位应当向劳动者支付经济补偿。根据法律规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得无故克扣或无故拖欠劳动者的工资。【法律依据】《劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。