云南农业大学好；

根据2020年全国大学排名，云南农业大学省内排名第五、大理大学省内排名第九，农业大学综合评价更高；

南农业大学为云南省属重点大学，入选国家卓越农林人才教育培养计划和卓越工程师教育培养计划，是全国第二批深化创新创业教育改革示范高校、全国创新创业典型经验高校、国家"2011计划"建设单位、中国政府奖学金来华留学生接收院校，具有研究生推免资格高校，拥有博士学位和硕士学位授予权，设有中国-东盟教育培训中心。

云南农业大学和大理大学都属于二本，大理大学医学类比较强，农大农业类比较强

这个得看你要学什么了。如果学医的话，选择大理大学；如果学农学，就选择云南农业大学。当然，个人觉得大理大学的整体专业比较适合文科生，云南农业大学的大部分专业适合理科生。如果想在省会城市，就选择云南农业大学；如果想去风景好一点的、综合性强一点的学校就去大理大学。