公交卡刷地铁是先刷卡进站，系统记录起始的地点，等到出站的时候，根据你乘车的路程长度计算费用，最后扣款出站，如果你的卡里费用不足，需要你跟值班人员说明情况，将所欠费用补足了，然后才可以出站，完成乘车。

需要说明的一点是，如果乘车时间超过三个小时，相当于两次乘车，就要重新开始计费