专项附加扣除表格由税务部门填写。税务部门负责管理纳税人的纳税事项，包括核定个人所得税的应纳税额和实际纳税情况。专项附加扣除是个人所得税改革的一项重要措施，旨在减轻个人所得税负担，促进个人消费和经济发展。

纳税人根据自己的实际情况填写相关信息，提交给税务部门，由税务部门核实并更新个人所得税纳税信息。因此，税务部门的角色至关重要，可以保障个人所得税的公平性和透明度。

专项附加扣除由本人在个税APP申报，选择单位为扣缴义务人。