深圳社保（医保）住院报销流程如下，基本医疗一档、基本医疗二档的待遇是一样的，统一报90%，在深圳所有定点医院都可以直接办理住院，报销比例都为90%;

1、首先需要申请人先办理报销申请手续，随后，提交报销所需要的相关申请材料，提交材料的地点在参保人所需的社保基金管理局各分区的社保分局医保科。

2、在接收到申请人的报销申请之后，管理局的受理部门将会在收到材料之日起至5日内对于申请人所提供的的申请材料进行核查，并决定最后的受理结果。

3、若申请材料有误或不齐全的话，受理部门将会通知申请人并告知其在这5日之内将所需材料一次性准备好，并修正材料中有误的内容。而申请人在收到《补正材料通知书》之日起的5日之内，要将材料补正完毕。超过期限将不予补正，并且撤回申请。

4、若在期限内补正材料完毕，可以在深圳医保报销的有效期内重新提出申请。