幼犬肠道菌群的改善方法包括多方面：合理的饮食、清洁卫生、抗生素的正确使用等。

饮食应富含益生菌和膳食纤维，并避免过多添加人工添加剂和化学成分；卫生要保持干净，避免交叉感染；抗生素使用要依照兽医指导，不可滥用。同时，可以考虑通过益生菌的补充来促进肠道功能的恢复，如乳酸菌、双歧杆菌等。最好在兽医的指导下进行肠道菌群改善方案的实施。