北海下雨对去涠洲岛会有一定影响，但不一定会停航。下雨可能导致海上风浪增大，船只航行受到一定限制，航班可能会延误或取消。船舶公司会根据天气情况和安全考虑来决定是否停航。因此，如果北海下雨，计划前往涠洲岛的人们应该提前了解航班情况，并根据实际情况做出相应的安排。