新生儿农合报销比例是：

1、剖腹产。报销起点为2000元，大于2000元但小于或等于7000元的部分医疗费用报销45%，超过7000元的医疗费用可报销65%；

2、顺产。乡级定点医疗机构住院定额补助300元，县级及以上定点医疗机构住院定额补助450元。根据相关法律规定可知，参保户将报销所需资料备齐后，交村或者社区合作医疗联络员，由村或社区合作医疗联络员审核后，报镇合作医疗联络员，再由镇联络员送区农易办结报中心进行报销。