五源河体育馆位于海口新市政府中央商务区东侧的五源河文体中心内，是海南省第一座甲级体育场，可举办全国性和单项国际比赛以及各类文化活动。新海港码头导航至五源河体育馆的原因可能有多种，以下是几种可能的解释：

路线规划：导航软件可能会根据实时交通情况、道路状况、距离等因素，为用户规划出最优路线。在某些情况下，即使目的地不是五源河体育馆，但导航软件可能会推荐经过五源河体育馆的路线，以避开拥堵或其他交通障碍。

地标定位：五源河体育馆作为海口市的一个显著地标，其位置可能在导航系统中被用作参考点或定位点，以帮助确定用户的位置或导航方向。

系统错误：也有可能是导航系统出现了错误或误判，将五源河体育馆作为了目的地或途经点。这种情况下，用户应该检查并确认自己的目的地和路线设置是否正确。

无论哪种情况，如果用户的目的地不是五源河体育馆，建议在导航过程中保持警惕，及时检查并调整路线，以确保能够准确到达目的地。同时，也可以尝试更新导航软件或联系客服寻求帮助。