东昌中学南校与东校在教学质量上没啥差别。学校设施与学习环境上，东校优于南校。另外，因为初中阶段是划区招生，所以东校学生城里孩子居多，而南校位于城郊，多招收的是农村孩子。

东校是一个独立的初中，而东昌中学南校全名为华东师范大学附属东昌中学南校。是东昌高中的初中部。相对来说，东昌南校的师资相对比较好一点。