卡罗莱纳箱有6个亚种：美国 东部箱龟 Terrapene carolina carolina(Linnaeus)1758美国 佛罗里达箱龟 Terrapene carolina bauriTaylor1895美国 湾岸箱龟 Terrapene carolina major(Agassiz)1857美国 三趾箱龟 Terrapene carolina triunguis(Agassiz)1857墨西哥 墨西哥箱龟 Terrapene carolina mexicana(Gray)1849墨西哥 犹加敦箱龟 Terrapene carolina yucatana(Boulenger)1895北美 无常用名 Terrapene carolina putnamiO.P. Hay1906 （已灭绝）