单位自建房办不动产证流程：首先开发商办理初始登记；

其次领取《房屋所有权登记申请表》，同时填写该表；

然后到开发商指定的房屋面积计量站申请并领取测绘表；领取相关文件，包括购房合同等；缴纳公共维修基金、契税；提交申请材料；领取不动产证。基本上不用缴纳什么费用。