厦门到昆明最便宜的交通方式是搭乘飞机。首先，从厦门到昆明的路程很长，搭乘高铁或者汽车需要很长时间，同时还有一些转车的情况，对于时间和精力成本的消耗都比较大。其次，虽然坐火车或者坐汽车也有很多的优点，但是它们相比于搭乘飞机来说，花费的费用还是比较高，且不方便。而且，搭乘飞机直飞昆明，省去了很多中转时间和中转费用，更加方便、快捷和便宜。当然，对于一些贵重的行李以及需要中转不方便的地方，火车或者汽车仍然是一个比较不错的选择。但是，在考虑时间、金钱、速度和方便性的情况下，搭乘飞机是最好的选择。