重庆医科大学的综合实力比西南医科大学强多了，是省部共建的省属重点大学，入选中西部高校基础能力建设工程，国家重点支持建设的西部地区十四所大学之一，有国家级重点学科，一级学科博士点，这些西南医科大学都没有。虽然西南医科大学的麻醉学也不错，属于国家级特色专业。但是我个人还是建议你去重庆医科大学。

重庆医科大学在重庆，西南医科大学在四川，两所完全不同的学校。重庆医科大学更强

重庆医科大学实力强，因为重庆医科大学属于211大学，全国排名比西南医科大学靠前，而且师资力量雄厚，之前是上海医科大学划分过来的。