肇庆市端州区前是没有设置镇的，原有的两镇即黄岗镇、睦岗镇，在行政规划设置上已经更改为黄岗街道和睦岗街道，严格意义上说，端州区目前是没有镇的。

端州区辖6个街道（城东、城西、城南、城北、康乐、古塔）、2个镇（黄岗、睦岗），22个村委会、57个居委会。