有四所大学。

1.菏泽学院，山东省和菏泽市政府联合创办的全日制高等本科学校。

2. 齐鲁工业大学菏泽分校，齐鲁工业大学和菏泽市政府创办的全日制高等夲科学校。

3.菏泽医学专科学校，省属公办全日制普通高等专科学校。

4.菏泽职业学校，菏泽市属高等职业教育院校。