从公元3世纪初到6世纪末，东吴、东晋、宋、齐、梁、陈六个朝代合称“六朝”。六朝时期建都南京，南京因此习称“六朝古都”，而当时六朝时期的南京城也是世界上第一个人口超过百万的城市，和古罗马城并称为“世界古典文明两大中心”。

南京六朝博物馆是中国展示六朝文物最全面的遗址博物馆，也是反映六朝文化最系统的专题博物馆。