地址不同。北京站在东城区，东紧挨东便门，东二环。西临东单，北望长安街。北京南站在丰台区永定门外。北京站发车方向为东北地区，北京南站发车方向大都是南方省城等。

北京站和北京南站是两个不同的车站。北京站在东城区，北京南站在丰台区。北京站建设较早，北京南站建设较晚。北京站依靠传统火车和城铁较多。北京南站依靠高铁为主。