崇明岛唐代以前是不存在的，直到公元618年，在今天的吕四渔场南面堆积出来了两个沙洲，称东沙、西沙，这便是崇明岛的前身。

到北宋时期，在1025年，在东沙洲西北又堆出来一个沙洲，称姚刘沙，渐渐的与东沙相连。

1101年，姚刘沙西北50里又堆积出来一个沙洲，取名三沙洲。

在这几个沙洲出现之后，附近水域的泥沙淤积速度开始加快，到元朝时又相继涨出营前沙、马驮沙、张蒲沙等10余处沙洲。与此同时上海市区、闵行区、浦东新区也逐渐被沙子堆了出来，元朝政府在今天上海市区的位置上设置了上海县，而在上海县之上则设立松江府。

明朝期间涨出的沙洲就更多了，总共涨出可马鞍沙、陈恩沙、高明沙、小阴沙、长沙、袁家沙、响沙、高头沙等30余沙洲。

不过沙洲的大量出现也加快了该水域的水流，尤其是洪水泛滥期间，这里的水流非常快，许多沙洲也因此被长江水冲毁，该地区的沙洲是不断地出现，又不断地被冲毁，呈现出来回往复但总体淤积面积持续上涨的趋势。

直到明末清初前后，这个地方终于形成了一个长200里，宽40里的一个大岛，崇明岛的雏形就此出现了。

后来经过清朝和民国，崇明岛的面积不断扩大，到了解放前夕崇明岛的面积已经有现在的60%，到上世纪60年代以后，随着泥沙的不断堆积，崇明岛与西北部的几个沙洲连接了起来，而这几个沙洲是属于江苏省的，这也导致今天崇明岛西北的启隆镇和海永镇属于江苏省。