如果单纯比较学科建设水平，安徽工业大学的工科实力更强。

安徽工业大学有13个一级学科硕士点，18个专业硕士点，2个一级学科博士点，1个博士后科研流动站，12个省级重点学科。安徽工程大学有省级重点学科6个，一级学科硕士点9个，专业硕士点7个。