独立学院与民办高校的区别是：

1、时间不一样：中国独立学院产生于1998年，以苏州大学与苏州大学教育发展基金会举办的中国第一所独立学院苏州大学文正学院成为标志。而中国民办高校已经有30余年历史。

2、数量不一样：截至2017年，独立学院有260所。截至2018年03月05日，全国独立设置民办普通高校467所（含中外合作办学11所）。

3、层次不一样：独立学院是实施本科学历教育的高等学校。而民办高校办学层次分专科和本科。