按照“分类保障，分级负担；统筹安排，保障基本”的原则使用和管理补助资金。补助资金采用因素法分配。乡镇卫生院人员经费保障按乡镇卫生院上一年底在编在岗人数和省级补助标准（分为人均5000元、4000元、3000元和2000元4档）补助；乡镇卫生院卫技人员奖励按乡镇卫生院上一年底在编在岗卫技人员人均4800、离退休人员人均3600元和各地财力分档补助。厦门市辖区所需资金由厦门承担。