四联疫苗和五联疫苗的最大区别就在于五联疫苗是由五种不同疫苗联合配制而成的复合制剂，而四联疫苗是由四种不同疫苗组成。五联疫苗是在四联疫苗的基础上多一组脊髓灰质炎疫苗，分别是百日咳、白喉、破伤风、B型嗜血流感杆菌和脊髓灰质炎疫苗。