澳门通关证的办理流程如下： 准备所需材料：有效期内的中国大陆护照、身份证、近期免冠照片以及填写好的《中国公民往来港澳地区申请表》； 前往户籍所在地的出入境管理中心提交申请材料； 缴纳相关费用； 领取澳门通关证。