南京大报恩寺塔并非一直维修中，而是经历过两次重建。第一次是在明朝洪武年间，因洪武皇帝朱元璋认为风水有碍，下令拆除了大报恩寺塔。第二次重建则是在清朝康熙年间，但因工期延误等因素，最终并没有完成重建。现存的大报恩寺塔遗址，也就是俗称的“鸡鸣寺塔”，是上世纪80年代进行考古发掘后才被发现的，现已成为南京市的旅游景点之一。