独立院校与民办学院在设立、举办方、办学位次、毕业证、学费等方面有区别：

1.设立 民办高校是按照民办教育促进法设立的，而独立学院是教育部行政规章设立的。独立学院一定是本科，而民办高校专本科都有。

2.举办方 独立学院的举办方一定是普通高校，合作方是社会力量，而民办则只有社会力量作为举办者，这是区分两者的最简单的一点。

独立学院是高等院校和社会资本合作开办的本科层次的院校，属于非公办性质。民办院校分为本科和专科，是民间资本开办的。