北京市公积金国管和市管的主要区别在于管理单位与适用对象、个人账号、贷款办理时间、还款方式、使用范围、审批时间与贷款额度。

管理单位与适用对象：国管公积金由中央国家机关住房资金管理中心管理，适用于中央国家机关、在京中央企业及其在职职工；市管公积金由各市住房公积金中心管理，适用于地方省市单位、城镇企业、事业单位职工12。

个人账号：国管公积金和市管公积金的个人账号不同1。

贷款办理时间：国管公积金贷款的办理时间通常为45-60天，而市管公积金贷款办理时间通常是30-45天2。

还款方式：国管公积金的还款方式有限，只能选择等额本息或等额本金；市管公积金贷款还款方式则可以任意选择，且市管公积金一般采用自由还款方式，可以根据自身经济状况调整月还款额23。

使用范围：国管公积金可以跨区域使用，但市管公积金只能在本地或在规定可异地贷款的城市使用1。

审批时间与贷款额度：市管公积金的审批时间相对较短，通常在7个工作日左右，由于有个人信用评级的存在，贷款额度可能相对较高；国管公积金的审批时间一般较长，可能需要20个工作日或更多，贷款额度根据固定标准确定，与个人信用评级无关3。

这些区别体现了国管公积金和市管公积金在管理、使用上的不同，主要取决于它们分别由中央和地方机构管理，适用于不同的缴纳群体和使用场景。