月牙泉是人工的。关于月牙泉的起源主要有四种说法，三种是自然形成，一种是说人工开采。但是，现在的月牙泉确实是人工的。

20世纪70年代中期，当地垦荒造田抽水灌溉及周边植被破坏、水土流失，导致敦煌地下水位急剧下降，月牙泉的水位也急剧下降。因此，敦煌市采取了多种方式给月牙泉补水。