题主的情况个人建议倾向去三甲医院体检中心可能更好一些，理由如下：

1、体检中心一般上班时间较为固定，不用值夜班，可以有时间照顾孩子；

2、题主是临床医生，到体检中心工作基本不用做很多适应就可以上手；

3、三甲医院的收入总体来说还是会高于疾控中心；

4、在三甲医院工作平台明显高于疾控中心，孩子或家人如果有些小病小痛可以很好解决。个人建议，仅供参考